一、流水式工厂化水产养殖
适宜于水源水质较好、换水成本较低的地方。如森林地带中下游，靠近淡水河的地方，或是海岸的岬角地带。由于当地水源无工业污染，水质清澈纯净，微量元素丰富，水量及水质变化不大，可引用河水或海水作为水源，搭建钢结构防风棚，保持进水与排水同时进行，这种叫流水式工厂化水产养殖。亦可保持一定的换水率，增加循环水养殖系统设备对养殖水体进行循环处理，以便使水质变化控制在极小的范围内，这样最有利于水产品的生长，这种形式被称作半流水式工厂化水产养殖。

二、全封闭循环水养殖
适用于优质水资源稀少的地方。如污染严重的城市郊区、海水或淡水河流被严重污染地区、内陆没有海水的地方，可实行全封闭循环水养殖，这种养殖模式对外界环境的依赖性小，系统稳定运行后可持续赢利，但前期土建及设备投入较高。

三、循环水水产育苗
水产育苗作为水产养殖环节的第一环，水质的好坏直接关系到下游的整个产业链的成败。因此，尽一切可能提高孵化率、减少畸胎及死胎十分重要。而经过系统设备处理后，稳定的水质对于提高育苗的孵化率等起着至关重要的作用。

四、水族馆及海洋馆工程
水族馆及海洋馆工程一般都建在城市的繁华地带，自然不能有效利用边远地区的水源，因此，循环水处理成套系统便成了唯一的选择。它的原理同高密度工厂化水产养殖如出一辙。只是养殖密度较小，但却因为要达到较好的观赏效果，对水质的清澈度有更高的要求。